Six Toa Inika, des nouveaux héros, arrivent dans l'île assiégée de Voya Nui, afin de retrouver des Toa Nuva. Ils trouvent à leur place les méchants Piraka et les membres de la résistance matoran qui luttent pour leur liberté. Lorsque quatre Piraka s'emparent des pouvoirs du puissant Brutaka, Toa Jaller et son équipe doivent lutter pour sauver leur vie.